La Direzione Generale è l’organo di competenza che svolge le funzioni di indirizzo, programmazione, e controllo al fine di assicurare il buon governo dell’azienda. E’ dotata di autonomia imprenditoriale e ha l’obbligo di rispondere alla Regione circa il proprio operato in base agli indirizzi, valutazioni e proposte espresse dagli organismi locali di riferimento politico-istituzionale. Il Direttore Generale è coadiuvato dal Direttore Sanitario e dal Direttore Amministrativo. La Direzione Generale dura in carica 3 anni.